В 1984 году окончил Ленинградский институт советской торговли, в 2001 году - юридический факультет Санкт-Петербургского государственного университета. Доктор экономических наук.
В 2007 году окончил курсы Военной академии Генерального штаба Вооруженных Сил РФ.
Сын от первого брака - Сергей Анатольевич Сердюков. Родился 23 июня 1986 года. Проживал вместе с матерью в Санкт-Петербурге.
Приёмная дочь — Анастасия Николаевна Похлебенина, студентка. Родилась в 1993 году. С 2011 года обучается на юридическом факультете Санкт-Петербургского государственного Университета. Владеет лошадьми, увлекается верховой ездой и путешествиями.
Дочь от второго брака — Наталья Анатольевна Сердюкова, школьница.
С 1985 по 1991 год работал заместителем заведующего секцией, заведующим секцией магазина № 3 Ленмебельторга (Ленинград). В 1991-1993 годах — на посту заместителя директора по коммерческой работе Ленмебельторга.
С 1993 года работал в АО «Мебель-Маркет» Санкт-Петербург — заместителем генерального директора (1993), директором по маркетингу (1993—1995), генеральным директором (1995—2000)
Служба в МНС
С 2000 по 2001 годы был заместителем руководителя Межрайонной инспекции ФНС России № 1 по Санкт-Петербургу (специализированная, по работе с крупнейшими налогоплательщиками Санкт-Петербурга). В мае 2001 года назначен заместителем руководителя Управления МНС России по Санкт-Петербургу, а в ноябре 2001 года — руководителем Управления МНС России по Санкт-Петербургу.
С февраля 2004 года — руководитель управления МНС России по Москве.
2 марта 2004 года он назначен заместителем Министра Российской Федерации по налогам и сборам. Через 2 недели 16 марта 2004 года стал исполняющим обязанности Министра Российской Федерации по налогам и сборам.
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 27 июля 2004 года № 999 назначен руководителем Федеральной налоговой службы России.
В 2006 году заработал 1,25 млн рублей, заняв последнее место по уровню доходов среди членов Правительства Российской Федерации.
23.04.2015