Почти одновременно с избранием главой партии Юлия Тимошенко получила и весомый пост в исполнительной власти - в конце декабря 1999-го она стала вице-премьером по ТЭК в правительстве Виктора Ющенко. В январе 2001 года Тимошенко была отправлена в отставку, а в феврале была помещена в следственный изолятор по обвинению в хищении миллиарда долларов, предназначенного на оплату российского газа. В марте 2001-го Печерский райсуд Киева отменил санкцию на арест Тимошенко, которая вышла из СИЗО со статусом репрессированного оппозиционера и значительным политическим рейтингом.
На парламентских выборах-2002 Юлия Тимошенко конвертировала рейтинг в 22 депутатских места в Верховной Раде IV созыва. Партия "Батькивщина" приняла участие в выборах в составе именного Блока Юлии Тимошенко, к которому также присоединились Украинская народная партия "Собор", Украинская Республиканская партия "Собор" и Украинская социал-демократическая партия.
В сентябре 2002 года члены "Батькивщини" приняли активное участие в массовых акциях против Президента Леонида Кучмы "Восстань, Украина!", которые называют одной из предтечей "оранжевой революции".
На президентских выборах-2004 поддержала Виктора Ющенко, активно принимала участие в массовых акциях в его поддержку и против фальсификации выборов. После победы Ющенко Юлия Тимошенко была назначена Премьер-министром Украины. Первое "оранжевое" правительство просуществовало с февраля по сентябрь 2005 года, постоянно критиковалось оппонентами. В период работы Кабмина Тимошенко была проведена реприватизация "Криворожстали". Постоянные конфликты между секретарем СНБО Петром Порошенко и правительством Тимошенко привели к отставке конфликтующих сторон. БЮТ перешел в оппозицию.
Во время пребывания Юлии Владимировны в премьерском кресле в партию "Батькивщина" влилась партия Михаила Бродского "Яблоко". В конце 2005-го – партия Богдана Губского "Единая Украина". В марте 2007 года Бродский объявил о возобновлении деятельности "Яблока", переименовав его в "Партию вольных демократов".
В парламентских выборах 2006 года «Батькивщина» снова участвовала в составе Блока Юлии Тимошенко, который получил 129 мандатов (22,29 % голосов), заняв 2-е место. В Верховной раде была создана Коалиция демократических сил в составе Блока Юлии Тимошенко, блока «Наша Украина» и Социалистической партии Украины. Кандидатом в премьеры от коалиции была Юлия Тимошенко, однако объединение развалилось, потому что СПУ и НУ не смогли согласовать кандидатуру спикера. В результате новое парламентское большинство (Антикризисную коалицию) создали Партия регионов, СПУ и КПУ, а БЮТ снова перешёл в оппозицию.
В списках БЮТ образца 2006 года было много бывших народных депутатов, которые в парламентах предыдущих созывов входили в состав провластного большинства, подконтрольного Президенту Леониду Кучме и которому БЮТ ранее оппонировал. Несмотря на заверения руководства блока о том, что люди "очистились от кучмизма", некоторые бютовцы (впрочем, как и нашеукраинцы) покинули свои фракции и присоединились к парламентскому большинству. Массовый переход оппозиционеров в коалицию послужил причиной того, что в апреле 2007 года Президент Виктор Ющенко инициировал роспуск Верховной Рады V созыва и проведение досрочных выборов.
На досрочных парламентских выборах 2007 года «Батькивщина» улучшила свой результат, получив 156 мандатов (30,71 % голосов) и заняв 2-е место. В Верховной раде по результатам выборов была сформирована Коалиция демократических сил фракций БЮТ и НУ-НС. Коалиция предложила президенту для назначения на пост премьер-министра кандидатуру Юлии Тимошенко. Президент внёс кандидатуру Юлии Тимошенко в парламент, который утвердил её в должности председателя Кабинета министров Украины.
С 2008 года «Батькивщина» является членом наблюдательного совета Европейской народной партии.
В 2009 году «Батькивщина» выдвинула Юлию Тимошенко кандидатом в президенты Украины. После её поражения на выборах парламентская коалиция прекратила своё существование, кабмин Юлии Тимошенко был отправлен в отставку. В парламенте была создана коалиция «Стабильность и реформы», в которую на индивидуальной основе вошли и отдельные народные депутаты от БЮТ. Юлия Тимошенко объявила о проведении «большой чистки» в партии.
ВО "Батькивщина" вместе с еще семью партиями из блоков НУНС и БЮТ вошла в объединенную оппозицию. Политические силы, не вошедшие в парламентское большинство, назвали своей целью немедленное проведение выборов Верховной Рады.
В ноябре 2011 года участие блоков политических партий в парламентских выборах было запрещено. В декабре 2011 года партия «Народная самооборона» заявила, что объединится с «Батькивщиной». Первый заместитель главы «Батькивщины» Александр Турчинов выразил уверенность, что к ним присоединятся и другие политические силы.
В марте 2012 года «Батькивщина», партия «Реформы и порядок» и Народный рух Украины объявили, что выдвинут единый партийный список на парламентских выборах 2012 года. В апреле лидер партии «Фронт перемен» Арсений Яценюк также объявил о присоединении к этому списку.
В итоге «Батькивщина» стала платформой для формирования единого избирательного списка под названием "Объединённая оппозиция "Батькивщина"", в который вошли члены партий «Реформы и порядок», Народный Рух Украины, «Фронт перемен», «За Украину!», «Народная самооборона», «Гражданская позиция», Социально-христианской партии и Меджлиса крымскотатарского народа. Список возглавил лидер «Фронта перемен» Арсений Яценюк, поскольку лидер «Батькивщины» Юлия Тимошенко находилась в тюремном заключении.
По итогам выборов «Объединённая оппозиция» получила 62 места в парламенте (25,55 % голосов) по пропорциональной системе и ещё 39, выиграв в 39 мажоритарных округах — в общей сложности 101 место (22,67 %) из 450. Лидером фракции Батькивщины был избран Яценюк.
14 июня 2013 года съезд партии «Фронт перемен» единодушно принял решение об объединении с ВО «Батькивщина» путем ликвидации и вступления членов «Фронта перемен» в ВО «Батькивщина», также к объединению присоединились партия «Реформы и порядок» и часть Народного Руха Украины.В этот же день прошел съезд Всеукраинского объединения «Батькивщина», который избрал Юлию Тимошенко председателем партии, бывшего лидера «Фронта перемен» Арсения Яценюка — председателем политсовета партии, Александра Турчинова — первым заместителем председателя партии и руководителем центрального штаба, бывшего лидера партии «Реформы и порядок» Сергея Соболева — заместителем руководителя центрального штаба.
17 июня 2013 депутат фракции ВО «Батькивщина» Юрий Стець был избран главой партии «Солидарность» и вошёл в состав политического совета Объединённой оппозиции, а сама партия вошла в состав Объединённой оппозиции.
4 февраля 2014 года из фракции ВО «Батькивщина» вышли Роман Забзалюк и лидер «Гражданской позиции» Анатолий Гриценко.
В январе 2014 года после
отстранения Виктора Януковича от должности президента, и возвращения конституции 2004 года, была сформирована правящая коалиция, в которую вошли партии Батькивщина, УДАР и Свобода. Эта коалиция сформировала коалиционное правительство, которое возглавил Арсений Яценюк.
26 августа стало известно о выходе из политсовета «Батькивщины» 20 человек, среди них: Александр Турчинов, Арсений Яценюк, Арсен Аваков, Сергей Пашинский, Андрей Парубий, Павел Петренко, Лилия Гриневич. Причиной по словам Авакова стало то, что им не удалось договорится с партией о слиянии с несколькими другими политическими силами и поставить во главе списка нынешнего премьер-министра Арсения Яценюка. Планируется создание новой политической партии путём перерегистрации уже существующей, её вероятное название — «Народный фронт».
14 сентября съезд ВО "Батькивщина" утвердил партийный список для участия в досрочных парламентских выборах.
Всего в избирательный список "Батькивщины" включены 216 кандидатов:
18.06.2019