Стыковка прошла в автоматическом режиме.
«Прогресс» должен был пришвартоваться к станции вечером 2 июля, однако у корабля вышла из строя автоматическая система сближения и стыковки «Курс». На расстоянии 2-3 километров от МКС она начала уводить грузовик в сторону.
Попытки перевести управление в ручной режим успехом не увенчались. Командир экипажа МКС Александр Скворцов передал с борта станции, что космонавты пронаблюдали «неконтролируемое вращение» корабля, пролетевшего мимо МКС.
4 июля специалисты Центра управления полетами провели коррекцию высоты орбиты «Прогресса», чтобы подготовить его к повторной стыковке.
При стыковке предыдущего грузовика – «Прогресса М-05М» - также произошли технические неполадки. Корабль, сблизившийся с МКС 1 мая 2010 года, пришлось пристыковывать к станции в ручном режиме.