Родился 2 января 1964 года в Баку в семье военнослужащего, по национальности - армянин. В Украине проживает с 1966 года.
В 1988-м окончил Харьковский политехнический университет по специальности автоматизированные системы управления (получил квалификацию инженер-системотехник).
Является заслуженным экономистом Украины. Автор 12 научных публикаций и одной монографии. Владеет русским и слобожанским языками.
Женат на Инне Аваковой, которая с 1994 по 2012 год занимала должность заместителя председателя правления ПАО «АКБ «Базис», входящего в состав АО «Инвестор».
Сын Александр (1988 г.р), предприниматель.
В 2002-м был избран членом исполнительного комитета Харьковского городского совета.
Во время президентской избирательной кампании 2004 года был заместителем руководителя Харьковского регионального штаба кандидата в президенты Виктора Ющенко, первым заместителем председателя Харьковского регионального «Комитета Национального спасения».
В феврале 2005-го получил должность председателя Харьковской облгосадминистрации, после чего сложил с себя полномочия председателя наблюдательных советов подконтрольных бизнес-структур - ОАО АКБ "Базис" и АО "Инвестор".
С 2006 года - депутат Харьковского областного совета от "Нашей Украины", член комиссии по вопросам бюджета.
5 февраля 2010 года, накануне повторного голосования на президентских выборах, Аваков, подержавший Юлию Тимошенко покинул пост губернатора , вступил в партию «Батькивщина» и возглавив Харьковскую облорганизацию партии ВО «Батькивщина».
В 2010 году принимал участие в выборах мэра Харькова, однако проиграл Геннадию Кернесу.
В январе 2012 года прокуратура открыла на Авакова уголовное дело по ст. 365 Уголовного кодекса Украины по факту злостного превышения власти и должностных полномочий, повлёкших тяжкие последствия. 21 марта 2012 года Аваков был официально объявлен в розыск Интерполом.
25 марта того же года Авакова задержали в Италии, но уже 12 апреля решением римского суда освобожден из-под стражи.18 октября 2012 года в Италии состоялся суд, решением которого Украине было отказано в экстрадиции Авакова.
На парламентских выборах 2012 года Аваков прошел в Верховную Раду под 24-м номером в списке ВО "Батьквщина". После получения статуса народного депутата вернулся в Украину.
22 февраля 2014 года Верховная Рада назначила Авакова и. о. министра внутренних дел Украины, 27 февраля - министра внутренних дел в правительстве Арсения Яценюка.
В 2014 году на досрочных выборах в Верховную Раду баллотировался по спискам партии "Народный фронт" под №6.
14 апреля 2016 г. парламент отправил в отставку премьер-министра Арсения Яценюка, поддержав на его место кандидатуру Владимира Гройсмана. В этот же день Рада утвердила новый состав Кабмина, в котором Аваков сохранил должность главы МВД.
29 августа 2019 года Верховная Рада утвердила новый состав Кабинета министров, Арсен Аваков вновь назначен министром внутренних дел.
4 марта 2020 года Верховная Рада проголосовала за отставку Алексея Гончарука с поста премьер-министра, это влечет за собой отставку всего правительства. В тот же день Верховная Рада утвердила новый состав Кабинета министров, Арсен Аваков вновь назначен министром внутренних дел Украины.
13 июля 2021 года Арсен Аваков подал заявление об отставке с поста министра внутренних дел. 15 июля Верховная Рада утвердила отставку Арсена Авакова с поста главы МВД.
Аваков является соучредителем Фонда им. Марианны Аваковой, который оказывает помощь детским домам, интернатам, детям-сиротам.
Сопредседатель оргкомитета Международного фестиваля фантастики «Звездный мост».
Глава наблюдательного совета Благотворительного фонда «Ренессанс», который занимается проведением благотворительных акций, концертов, аукционов, реставрацией и возрождением памятников истории и архитектуры, грантовой поддержкой молодых ученых, научных программ, детского творчества.
В 2008—2010 годах был председателем Харьковского областного отделения Национального олимпийского комитета.
Чтение (поклонник фантастики), путешествия, фотография, футбол, нумизматика.
15.07.2021