Архиепископ Евстратий (в миру Иван Владимирович Зоря) родился 21 октября 1977 в городе Черкассы.
После завершения учёбы в средней школе в 1994 году поступил в Киевскую духовную семинарию УПЦ КП, а после окончания в 1997 году — в Киевскую духовную академию (КДАиС).
После завершения учёбы в 2001 году защитил диссертацию на тему «Украинский экзархат РПЦ (1944—1966 гг.)» и получил степень кандидата богословия.
С 1992 по 1996 годы — иподиакон епископа Черкасского и Чигиринского Нестора (Кулиша) в юрисдикции Украинской православной церкви Киевского патриархата (УПЦ КП).
Преподаватель КДАиС (ныне — Киевской православной богословской академии).
С 1997 по 1998 годы — иподиакон главы УПЦ КП Филарета (Денисенко). В 1997 году поступил в Михайловский Златоверхий монастырь в Киеве.
По благословению Филарета (Денисенко) 12 апреля 1998 года пострижен в монашество с именем Евстратий. 16 апреля 1998 года рукоположён во иеродиакона, 4 июня 2000 года — во иеромонаха. Назначен штатным священником Михайловского Златоверхого собора.
1 ноября 2002 года назначен пресс-секретарём Киевской патриархии. 28 апреля 2003 возведён в сан игумена, а 4 февраля 2007 — в сан архимандрита.
13 мая 2008 Священным синодом избран епископом Васильковского, викария Киевской епархии, с назначением главой информационно-издательского управления Киевской патриархии.
25 мая 2008 года состоялась хиротония архимандрита Евстратия во епископа Васильковского, викария Киевской епархии.
На заседании Священного синода УПЦ КП, прошедшем 27 июля 2010 года, епископ Евстратий был назначен на должность секретаря Синода (без постоянного членства в Синоде).
С 13 мая 2011 года — епископ Богуславский, викарий Киевской епархии.
23 января 2012 года возведён в сан архиепископа и назначен управляющим Черниговской епархией УПЦ КП.
В октябре 2014 года указом Патриарха назначен Представителем Киевского Патриархата при Европейских институтах.
15 декабря 2018 вместе со всеми другими архиереями УПЦ КП принял участие в Объединительном соборе в храме Святой Софии.
5 февраля 2019 года митрополит Киевский и всея Украины Епифаний назначил владыку Евстратия в состав первого Священного синода Православной церкви Украины.
6 марта 2019 решением Митрополита Киевского Епифания был назначен заместителем председателя Управления внешних церковных связей Православной церкви Украины.
Является главным редактором газеты «Голос православия», официального печатного издания Украинской православной церкви Киевского патриархата.
07.02.2020