В 1997 году окончил Академию Вооруженных Сил Украины, учился на оперативно-тактическом факультете.
В марте 2011 года получил степень кандидата военных наук, защитив диссертацию по специальности "Служебно-боевая деятельность сил охраны правопорядка".
23 августа 2011 г. Аллерову было присвоено военное звание генерал-майора.
2012 г. – начальник правления Южного территориального командования ВВ МВД Украины, в августе того же года вернулся на должность начальника Западного теруправления ВВ МВД. Весной 2014 года это теруправление стало подразделением Нацгвардии.
23 августа 2014 г. - Аллеров получил звание генерал-лейтенанта ВСУ.
30 декабря 2015 года указом президента Петра Порошенко Юрий Аллеров назначен командующим Национальной гвардии Украины. Представляя нового командира НГУ, Порошенко отметил, что знает Аллерова как "настоящего воина, который достойно проявил себя в наиболее тяжелые периоды проведения АТО".
23 августа 2017 года присвоено воинское звание генерала-полковника.
7 мая 2019 года Президент Петр Порошенко уволил командующего Национальной гвардии Украины Юрия Аллерова.
08.05.2019