В 1961 году семья переехала в Харьков, где Семиноженко с отличием закончил Харьковскую физико-математическую школу № 27. В 1972 году с отличием закончил физико-технический факультет Харьковского государственного университета.
В 1974 году защитил кандидатскую диссертацию. С 1984 года — доктор физико-математических наук, с 1988 года профессор.
В 1992 году стал академиком Национальной академии наук Украины.
С 1985 года работал генеральным директором Всесоюзного научно-производственного объединения «Монокристаллреактив» Министерства химической промышленности СССР.
В 1995 году объединение по инициативе Семиноженко преобразовано в первый академический научно-технологический концерн Институт монокристаллов НАН Украины (впоследствии научно-технологический комплекс).
С 1996 года Семиноженко — научный руководитель концерна.
В настоящее время — Председатель Совета директоров, научный руководитель НТК «Институт монокристаллов» НАНУ, в состав которого входят: Институт монокристаллов, Институт сцинтилляционных материалов, Отделение химии функциональных материалов, ГП «Научно-исследовательский институт микроприборов», Научно-технический центр иммунобиотехнологии, ГП «Завод химических реактивов».
1994 - 2001 гг. - народный депутат Украины 2, 3-го созывов.
С 1996 по 1998 год возглавлял Министерство науки и технологий. Приложил большие усилия для формирования целостной системы государственного управления по принципу «наука — технологии — инновации — защита интеллектуальной собственности», реализации важных для отечественной экономики научно-технических разработок, подготовки проектов законодательных и нормативных актов, направленных на сохранение и развитие научно-технологического потенциала государства.
1998 - 2000 гг. - заместитель Председателя Совета по вопросам науки и научно-технической политики при Президенте Украины. Член Национального совета по вопросам качества.
1999 г., 2001 - 2002 гг., 2010 г.- Вице-премьер-министр Украины.
Один из основателей и первых руководителей Партии регионов (2001—2003). Вышел из партии в связи с несогласием с линией её развития (2004).После него партию возглавил Виктор Янукович.
2003 - 2006 гг. - председатель Межведомственной комиссии по вопросам биологической и генетической безопасности при Совете Национальной безопасности и обороны Украины.
2003 - 2005 гг. - советник Президента Украины Леонида Кучмы.
Один из основателей, Председатель Общественно-политического объединения «Украинский форум» (2006).
В 2009 году возглавил Гражданское движение «Новая Украина», созданное по инициативе «Украинского форума», ряда других общественных организаций и партий. В этом же году возглавил политическую партию «Новая политика».
С июля 2010 года — Председатель Государственного комитета Украины по вопросам науки, инноваций и информатизации, позднее реформированного в Государственное агентство по вопросам науки, инноваций и информатизации Украины, советник Премьер-министра Украины.
С 2013 по 2014 годы возглавлял Межгосударственный совет по вопросам сотрудничества в научно-технической и инновационной сферах стран СНГ.
В 2014 году подал в отставку с поста главы Госинформнауки в знак несогласия с проводимыми реформами в сфере управления наукой, против которых выступили ведущие украинские ученые и президенты всех национальных академий наук.
Владимир Семиноженко принимал участие в создании и принятии Конституции Украины (1996), один из авторов Конституционного договора (1995).
Автор и основной лоббист Законов «О науке и научно-технической деятельности» (1998г.), который обеспечил «научные пенсии», «Об инновационной деятельности» (2012 г.), «О специальном режиме инвестиционной и инновационной деятельности технологических парков» (1999г.), «О всеобщем среднем образовании» (1999 г.), «О специальном режиме инвестиционной деятельности на территории Харькова» (2000 г.). «О государственном регулировании деятельности в сфере трансферта технологий» (2012 г.), сыграл важнейшую роль в принятии Закона «О высшем образовании» (2014 г.) в действующей редакции.
В 1996 год возглавил инициативную группу по созданию Национальной академии искусств. По поручению Президента и Кабинета Министров Украины проводил первое заседание по избранию членов Президиума и Президента Национальной академии искусств.
В 2004 году сыграл решающую роль в разрешении конфликта вокруг объединения трех вузов: Сумского национального аграрного университета, Сумского Государственного педагогического университета им. Макаренко и Сумского государственного университета в Сумской национальный университет (СНУ), который привел к массовым волнениям студентов.
Инициировал учреждение профессионального праздника работников науки — Дня науки (Указ Президента Украины от 14 февраля 1997 года № 145/97)
Добился учреждения профессионального праздника — Дня фармацевтического работника (Указ Президента Украины от 7 сентября 1999 года N 1128/99)
Инициировал и обеспечил получение Украиной статуса ассоциированного члена ЦЕРН. Соглашение ратифицировано ВРУ в сентябре 2014 г.
За время работы Председателем Государственного агентства по вопросам науки, инноваций и информатизации обеспечил создание основ Электронного правительства на Украине.
Обеспечил делегирование Украине национального кириллического домена. УКР (28 февраля 2013 г.).
Главный редактор журнала «Функциональные материалы», который входит в десятку ведущих научных журналов Украины. Главный редактор альманаха сравнительных исследований «Ойкумена», членом редколлегии научно-практического журнала Совета национальной безопасности и обороны Украины «Стратегическая панорама».
27.11.2015