2000-2003 гг. - президент Национальной атомной энергогенерирующей компании Энергоатом.
2003-2005 гг. - помощник-консультант народного депутата от блока Наша Украина Виктора Ющенко.
2005-2006 гг. - президент НАЭК Энергоатом.
В 2006-м - заместитель министра топлива и энергетики Юрия Бойко.
С 18 июня 2008 распоряжением Кабинета министров Украины снова назначен президентом НАЭК Энергоатом. Сменил на посту представителя Партии регионов Андрея Деркача.
20 августа 2012 года распоряжением Кабмина уволен с должности президента Энергоатома "в связи с невыполнением условий контракта".
С 5 марта 2014 года - снова президент Энергоатома.
27 ноября 2019 года Кабинет министров уволил Юрия Недашковского с должности президента Энергоатома.
28.11.2019